Las desventajas son: 1. Algunas personas o grupos de huellas dactilares tienen pocas funciones de huellas dactilares y son difíciles de obtener imágenes 2. En el pasado, debido a que las huellas dactilares se usaban en los antecedentes penales, algunas personas tenían miedo de "registrar huellas dactilares". De hecho, la tecnología de autenticación de huellas dactilares no puede almacenar datos que contengan imágenes de huellas dactilares, sino solo almacenar propiedades de huellas dactilares encriptadas obtenidas de la huella dactilar 4. Cada vez que se utiliza la huella dactilar, la colección de huellas dactilares del usuario permanecerá.